Теорія cигналів, Теорія біомедичних сигналів, Реєстрація і обробка біосигналів і медичних зображень

 




Список рекомендованої літератури
Рейтингова система

Протоколи лабораторних робіт

Шаблон титульного аркуша протоколу
Лабораторна робота № 1. Основи програмування на Python
Лабораторна робота № 2. Візуалізація сигналів з допомогою Python
Лабораторна робота № 3. Моделювання лінійних систем в часовій та частотній області
Лабораторна робота № 4. Спектральний аналіз сигналів за Фурьє
Лабораторна робота № 5. Спектрально-часовий аналіз сигналів за Фурьє
Лабораторна робота № 6. Фільтрація сигналів
Лабораторна робота № 7*. Кореляційний аналіз детермінованих сигналів - виконується самостійно, не обов'язкова, за додаткові бали
Лабораторна робота № 8*. Вейвлет-аналіз сигналів - виконується самостійно, не обов'язкова, за додаткові бали

Порядок виконання та здачі лабораторних робіт

Допуск до виконання роботи

Для допуску до виконання лабораторної роботи студент повинен знати основні теоретичні відомості щодо роботи, яку він буде виконувати, бути знайомим з порядком виконання роботи, уявляти, які результати мають бути отримані в роботі. В кінці кожного заняття студент повинен пред'явити результати, які були отримані ним протягом роботи в класі. Вразі виявлення незадовільної роботи протягом заняття та відсутності результатів роботи, студент вважається таким, що недопущений до виконання роботи і повинен виконати її в інший час.

Здача роботи

На визначеному викладачем занятті студент повинен надати оформлений протокол виконаної роботи з результатами і висновками. Всі обов'язкові завдання повинні бути виконані. Також необхідно мати програмний код роботи. Захист відбувається разом з перевіркою працездатності програми. З використанням протоколу та програмного коду проводиться співбесіда по теоретичним питанням, результатам та виконанню роботи. Вразі правильних відповідей робота вважається виконаною та зарахованою.

Вимоги до протоколу

Протоколи лабораторних робіт надаються в електронному вигляді.

  • протокол виконання роботи оформлюється один на кожного студента. У випадку виявлення ідентичних за змістом протоколів, всі студенти отримують за дану роботу 0 балів без права перездачі та не допускаються до виконання всіх наступних робіт без допуску, підписаного завідувачем кафедри;
  • в протоколі повинні бути викладені: мета роботи, текст завдання, лістінг коду програми, належно оформлені графіки та рисунки, висновки;
  • в протоколі повинні бути відображені результати виконання ВСІХ пунктів завдання (у випадку повторення – один приклад на кожний пункт, де є повторення);
  • лістінг коду програми повинен містити код для виконання всіх пунктів завдання з усіма повтореннями;
  • висновки не повинні дублювати завдання та мету роботи, а повинні містити оцінку та аналіз результатів, отриманих в роботі, порівняння практичних результатів з теоретичними положеннями, власні міркування щодо можливих причин розбіжностей.

Титульний аркуш протоколу повинен містити:

  • назву факультету/інституту;
  • назву дисципліни;
  • номер та назву роботи;
  • ім'я та прізвище студента, шифр та номер його групи.

Умови атестацій

Для отримання атестації необхідно набрати 50% від максимальної кількості балів, яку можна мати на час атестації. Перед кожною атестацією студентам буде доведено кількість балів, яку треба отримати.

Файли з сигналами для завантаження/ Files with signals

сигнали стабілограми / center-of-pressure recordings
сигнали серцевого ритму (HR) та сатурації артеріальної крові киснем (SpO2) / heart rate (HR), and arterial oxygen level (SpO2)
нормальна ЕКГ / healthy person ECG
ЕКГ з аномаліями / ECG with anomalies
сигнал внутрішньочерепного тиску / intracranial pressure
сигнали ЕКГ / ECG signals
сигнали ЕЕГ здорової людини / EEG signals, healthy
сигнали ЕЕГ хворої людини / EEG signals, epilepsy
сигнал кардіоритмограми хворої людини / cardiorhythmogram, disease
сигнал кардіоритмограми здорової людини / cardiorhythmogram, healthy
багатоканальний сигнал ЕЕГ здорової людини / multichannel EEG, healthy

Курсова робота / Розрахунково-графічна робота

До першої атестації з КР необхідно виконати та здати на перевірку першу частину КР/РГР та обрати тему для третьої частини КР. Обрання теми підтверджується записом в списку, який знаходиться у викладача. Можна запропонувати власну тему (необхідно узгодити її з викладачем). Для отримання атестації треба набрати 50% балів.

До другої атестації необхідно виконати та здати на перевірку першу, другу та третю (в разі необхідності) частини роботи. Для отримання атестації треба набрати 50% балів.

В кінці семестру кожному студенту в залежності від набраних балів буде запропоновано оцінку, яку можна отримати автоматом. Вразі незгоди оцінка виставляється за результатами захисту КР.

При невчасній здачі роботи на перевірку бали за виконані завдання діляться навпіл.

Питання для отримання оцінки Е

  1. Поняття про дискретизацію і квантування сигналів, зв'язок між частотою та кроком дискретизації. Вибір частоти дискетизації за теоремою Котельникова-Шеннона.
  2. Лінійні дискретні системи: визначення та основні властивості (стаціонарність, детермінованість).
  3. Різницеві рівняння лінійних систем та побудова структур для їх реалізації. Розрахунок вихідного сигналу лінійної системи за різницевим рівнянням.
  4. Імпульсна характеристика лінійної дискретної системи, її отримання та використання для розрахунку вихідного сигналу.
  5. Комплексна частотна характеристика лінійної дискретної системи, її використання для розрахунку вихідного сигналу системи.
  6. Поняття розкладу сигналів в базисі. Отримання коефіцієнтів розкладу сигналу в ортогональному базисі.
  7. Перетворення Фурьє дискретних скінченних сигналів, його викорстання. Амплітудний та фазовий спектр.
  8. Поняття частотно-часового аналізу сигналів, його використання. Спектрограмма.
  9. Фільтрація сигналів, типи та параметри фільтрів.
  10. Кореляційний аналіз детермінованих сигналів, взаємно- та автокореляційна функції. Коефіцієнт кореляції.

Відеозаписи лекцій

2016-2017 рр.

Лекція 1. Вступ до Теорії сигналів
Лекція 2. Види сигналів
Лекція 3. Аналого-цифрове перетворення. Дискретні сигнали (немає початку і кінця)
Лекція 4-5. Лінійні дискретні системи та їх характеристики
Лекція 6. Розклади сигналів - 1. Основні поняття простору сигналів
Лекція 7. Розклади сигналів - 2. Представлення сигналів в Гільбертових просторах. Теорема ортогонального проектування.
Лекція 8. запису немає
Лекція 9. запису немає
Лекція 10. запису немає
Лекція 11. Спектральний аналіз сигналів за Фурьє - 3. Накладання спектрів. Розтікання спектрів. Теорема Котельникова.
Лекція 12. Спектральний аналіз сигналів за Фурьє - 4. Віконна обробка, спектрограма. Перетворення Хартлі (немає початку)
Лекція 13. Фільтрація сигналів
Лекція 16. Аналіз двовимірних сигналів
Лекція 17. Перетворення Уолша-Адамара, Хартлі, вейвлет

Лекція 0. Біомедичні сигнали
Лекція 1. Вступ до Теорії сигналів - 2012
Лекція 2. Види сигналів
Лекція 3. ч. 1 Дискретні сигнали та послідовності, ч. 2 Дискретні системи, загальні визначення
Лекція 4. Опис лінійних дискретних систем (різницеве рівняння, імпульсна характеристика, характеристична функція)
Лекція 5. Комплексна частотна характеристика лінійної системи. Простори сигналів
Лекція 6. Розклади сигналів
Лекція 7. Спектральний аналіз сигналів-1. Аналіз за Фурьє неперервних сигналів
Лекція 8. Спектральний аналіз сигналів-2. Аналіз за Фурьє дискретних сигналів
Лекція 9. Спектральний аналіз сигналів-3. Накладання спектрів. Ефект Гіббса. Теорема Котельникова-Шеннона
Лекція 10. Спектральний аналіз сигналів-4. Віконна обробка. Частотно-часовий аналіз. Перетворення Уолша-Адамара
Лекція 11. Вейвлет-перетворення сигналів
Лекція 12. Фільтрація сигналів-1. Параметри фільтрів, проектування фільтрів, аналогова фільтрація
Лекція 13. Фільтрація сигналів-2. Методи проектування цифрових фільтрів, структури цифрових фільтрів. Багатошвидкісна обробка сигналів
Лекція 14. Модуляція сигналів-1. Амплітудна, кутова та квадратурна модуляція
Лекція 15. Модуляція сигналів-2. Маніпуляція. Передача цифрових сигналів
Лекція 16. Мультиплексування інформаційних каналів. Поняття про випадкові сигнали
Лекція 17. Основні поняття Data Mining

Theory of Biomedical Signals

 

Useful links

Recommended readings
Rating System
Course content
Exam questions
Course work tasks

Laboratory works

Laboratory work # 1. Basics of Python programming
Laboratory work # 2. Signal visualization using Python
Laboratory work # 3. Modeling of linear systems in time and frequency domain
Laboratory work # 4. Fourier spectral analysis of signals
Laboratory work # 5. Time-Spectral Fourier analysis of signals
Laboratory work # 6. Signal filtering
Laboratory work # 7*. Correlation analysis of deterministic signals
Laboratory work # 8*. Wavelet analysis

Цифрова обробка сигналів у системах діагностики і терапії

 

Розклад

13.12.2017, 14-15, 437-12 -- останнє заняття, консультація щодо виконання самостійних робіт
20.12.2017, 14-15, 437-12 -- захит самостійних робіт
27.12.2017, 14-15, 437-12 -- залік
питання на залік

Біокібернетика та робототехніка-2. Цифрова обробка і аналіз сигналів в біомедичних системах

 

Методичні матеріали

РГР, пдф

Протоколи лабораторних робіт

Лаб.1
Лаб.2
Лаб.3
Лаб.4

Лекції

Introduction
Applications
Classification of biosignals
Linear Univariate
Nonlinear Univariate
Multivariate measures (sleep staging case)
Image processing
Machine Learning elements
EEG processing
Fuzzy logic and Alzheimer's Disease

Цифрова обробка та візуалізація біомедичних сигналів і зображень

 

Увага!

Для підготовки до кожного практичного заняття необхідно ознайомитися з теоретичними відомостями, викладеними в книзі Гонсалес, Р. Цифровая обработка изображений / Р. Гонсалес, Р. Вудс. - М. : Техносфера, 2005. - 1072 с. - ISBN 5-94836-028-8.
На кожне практичне заняття необхідно прийти, маючи в себе заздалегідь ті зображення, обробка яких описана в книзі у відповідному розділі. Завантажити зображення можна тут .

Список літератури з дисциплін "Цифрова обробка та візуалізація біомедичних сигналів і зображень"

Методичні вказівки для виконання лабораторних робіт

Основи обробки та аналізу зображень

Питання до заліку

  1. Задачі, види етапи обробки та аналізу зображень.
  2. Представлення зображень в цифровій формі.
  3. Зорове та кольорове сприйняття зображень. Представлення зображень в цифровій формі.
  4. Способи отримання зображень. Системи реєстрації зображень. Приклади. Представлення зображень в цифровій формі.
  5. Гістограмна обробка зображень. Еквалізація гістограм.
  6. Градаційна обробка зображень. Гамма-корекція.
  7. Просторова фільтрація зображень, використання масок.
  8. Просторова фільтрація зображень, медіанна фільтрація.
  9. Методи знаходження границь на зображеннях. Метод Собеля.
  10. Методи знаходження границь на зображеннях. Метод Кенні.
  11. Частотна фільтрація зображень.
  12. Вейвлет-аналіз зображень.
  13. Для даного зображення виконати медіанну фільтрацію для отримання пікселів відфільтрованого зображення, які відповідають позначеним пікселям. Навести всі розрахунки.
  14. Для даного зображення виконати фільтрацію з використанням заданої маски для отримання пікселів відфільтрованого зображення, які відповідають позначеним пікселям. Навести всі розрахунки.

Методи і засоби інтроскопії

 

Методичні вказівки до лабораторних робіт

Питання на іспит